Diversity of Canadian meningococcal serogroup B isolates and estimated coverage by an investigational meningococcal serogroup B vaccine (4CMenB)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: In collaboration with the Canadian Immunization Monitoring Program Active (IMPACT), the National Microbiology Laboratory, the UK Health Protection Agency and Novartis Vaccines, we tested the potential of an investigational 4-component meningococcal B vaccine (4CMenB) to cover Canadian strains circulating from 2006 to 2009. METHODS: IMPACT meningococcal surveillance is population based and includes over 50% of Canadian adults and children. All isolates were characterized by Meningococcal Antigen Typing System (MATS) and sequencing for factor H-binding protein (fHbp), Neisseria Heparin Binding Antigen (NHBA) and Neisserial adhesin A (NadA). RESULTS: In total, 157 isolates were tested. Overall, 4CMenB MATS predicted strain coverage was 66% (95% CI: 46-78%), with 26%, 29% and 11% of strains covered by one, two and three vaccine antigens, respectively. The coverage of each antigen was as follows: 13% PorA, 1% NadA, 52% fHbp and 51% NHBA. The majority of strains for clonal complex (cc) 41/44 and cc60 were covered by NHBA; the majority of strains for cc269 and cc32 were covered by fHbp and NHBA. Coverage for two prevalent strains (sequence type (ST)-269 and ST-154) was 95% and 100%, respectively. CONCLUSIONS: 4CMenB has the potential to protect against a significant proportion of Canadian invasive MenB strains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».