Cell surface antigen CD109 is a novel member of the α2 macroglobulin/C3, C4, C5 family of thioester-containing proteins
Notice bibliographique
Résumé
Cell surface antigen CD109 is a glycosylphosphatidylinositol (GPI)-linked glycoprotein of approximately 170 kd found on a subset of hematopoietic stem and progenitor cells and on activated platelets and T cells. Although it has been suggested that T-cell CD109 may play a role in antibody-inducing T-helper function and it is known that platelet CD109 carries the Gov alloantigen system, the role of CD109 in hematopoietic cells remains largely unknown. As a first step toward elucidating the function of CD109, we have isolated and characterized a human CD109 cDNA from KG1a and endothelial cells. The isolated cDNA comprises a 4335 bp open-reading frame encoding a 1445 amino acid (aa) protein of approximately 162 kd that contains a 21 aa N-terminal leader peptide, 17 potential N-linked glycosylation sites, and a C-terminal GPI anchor cleavage-addition site. We report that CD109 is a novel member of the alpha 2 macroglobulin (alpha 2M)/C3, C4, C5 family of thioester-containing proteins, and we demonstrate that native CD109 does indeed contain an intact thioester. Analysis of the CD109 aa sequence suggests that CD109 is likely activated by proteolytic cleavage and thereby becomes capable of thioester-mediated covalent binding to adjacent molecules or cells. In addition, the predicted chemical reactivity of the activated CD109 thioester is complement-like rather than resembling that of alpha 2M proteins. Thus, not only is CD109 potentially capable of covalent binding to carbohydrate and protein targets, but the t(1/2) of its activated thioester is likely extremely short, indicating that CD109 action is highly restricted spatially to the site of its activation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».