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Enregistrement W2067220192 · doi:10.2174/1875693x00801010013

Molecular Genetic Etiology of Prostate Cancer

2008· article· en· W2067220192 sur OpenAlexafffund
Vaijayanti Pethe, Bharati Bapat

Notice bibliographique

RevueThe Open Genomics Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Prostate Cancer Research Initiative
Mots-clésProstate cancerTMPRSS2BiologyLocus (genetics)GeneticsGenetic predispositionGenotypingSingle-nucleotide polymorphismAlleleDiseaseGeneCancerGenotypeInternal medicineMedicineInfectious disease (medical specialty)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prostate Cancer (PCa) is the most frequently diagnosed non-skin cancer and second leading cause of cancer deaths after lung cancer in the western industrialized countries.It varies widely by geographic location and ethnicity.It is clinically heterogeneous, complex and indeed a multi-factorial disease.While the majority of PCa is sporadic, as much as up to 40% of the cases are associated with some form of genetic susceptibility.It is clear today that etiology of PCa involves several genetic loci with no single major gene accounting for a large proportion of susceptibility to the disease.In particular, allelic variations in four genes, namely RNASEL (1q25), MSR1 (8p22), ELAC2 (17p11) and EphB2 (1p36) have been shown to be associated with increased susceptibility to PCa.Also, tumors harboring mutations in these genes present with more aggressive clinical features and poor outcome.Recently, novel genetic alterations in prostate cancer patients have been identified -these include gene fusions involving the prostate-specific gene transmembrane protease, serine 2 (TMPRSS2) and members of the erythroblastosis virus E26 transforming sequence (ETS) family of transcription factors.This predominant molecular subtype is considered to be an early event in PCa, and emerging evidence demonstrates its potential in prostate cancer detection, stratification and treatment.In addition to gene fusions, there is compelling evidence demonstrating 8q24 region as a prostate cancer susceptibility locus and markers at this locus are statistically significantly associated with an increased PCa risk in different ethnic groups.Genotyping of SNPs / markers in a predefined 8q24 region as well as genome-wide association studies have implicated several polymorphisms ( rs7008482, rs1447295, rs16901979, rs698367) in this region as risk factors for PCa.In additions to genetic alterations, frequent epigenetic aberrations such as DNA hypermethylation of tumor suppressor genes has been observed in PCa affecting the expression and function of a battery of genes leading to tumorigenesis, tumor progression and metastasis.In this review, we highlight some of the recent advances in molecular genetic etiology of PCa including promising candidate hereditary PCa susceptibility genes, novel gene fusions in acquired PCa, 8q24 susceptibility locus, as well as examine current literature regarding epigenetic changes leading to prostate cancer development and progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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