Crystal Structure of β-Barrel Assembly Machinery BamCD Protein Complex
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The β-barrel assembly machinery (BAM) complex of Escherichia coli is a multiprotein machine that catalyzes the essential process of assembling outer membrane proteins. The BAM complex consists of five proteins: one membrane protein, BamA, and four lipoproteins, BamB, BamC, BamD, and BamE. Here, we report the first crystal structure of a Bam lipoprotein complex: the essential lipoprotein BamD in complex with the N-terminal half of BamC (BamC(UN) (Asp(28)-Ala(217)), a 73-residue-long unstructured region followed by the N-terminal domain). The BamCD complex is stabilized predominantly by various hydrogen bonds and salt bridges formed between BamD and the N-terminal unstructured region of BamC. Sequence and molecular surface analyses revealed that many of the conserved residues in both proteins are found at the BamC-BamD interface. A series of truncation mutagenesis and analytical gel filtration chromatography experiments confirmed that the unstructured region of BamC is essential for stabilizing the BamCD complex structure. The unstructured N terminus of BamC interacts with the proposed substrate-binding pocket of BamD, suggesting that this region of BamC may play a regulatory role in outer membrane protein biogenesis.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle