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Enregistrement W2067411650 · doi:10.1186/ar2595

Egr-1 inhibits the expression of extracellular matrix genes in chondrocytes by TNFα-induced MEK/ERK signalling

2009· article· en· W2067411650 sur OpenAlexafffund
Jason S. Rockel, Suzanne M. Bernier, Andrew Leask

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMAPK/ERK pathwayExtracellular matrixTumor necrosis factor alphaRheumatologyCell biologyGene expressionExtracellularSignalling pathwaysGeneChemistryCancer researchInternal medicineMedicineSignal transductionBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: TNFalpha is increased in the synovial fluid of patients with rheumatoid arthritis and osteoarthritis. TNFalpha activates mitogen-activated kinase kinase (MEK)/extracellular regulated kinase (ERK) in chondrocytes; however, the overall functional relevance of MEK/ERK to TNFalpha-regulated gene expression in chondrocytes is unknown. METHODS: Chondrocytes were treated with TNFalpha with or without the MEK1/2 inhibitor U0126 for 24 hours. Microarray analysis and real-time PCR analyses were used to identify genes regulated by TNFalpha in a MEK1/2-dependent fashion. Promoter/reporter, immunoblot, and electrophoretic mobility shift assays were used to identify transcription factors whose activity in response to TNFalpha was MEK1/2 dependent. Decoy oligodeoxynucleotides bearing consensus transcription factor binding sites were introduced into chondrocytes to determine the functionality of our results. RESULTS: Approximately 20% of the genes regulated by TNFalpha in chondrocytes were sensitive to U0126. Transcript regulation of the cartilage-selective matrix genes Col2a1, Agc1 and Hapln1, and of the matrix metalloproteinase genes Mmp-12 and Mmp-9, were U0126 sensitive--whereas regulation of the inflammatory gene macrophage Csf-1 was U0126 insensitive. TNFalpha-induced regulation of Sox9 and NFkappaB activity was also U0126 insensitive. Conversely, TNFalpha-increased early growth response 1 (Egr-1) DNA binding was U0126 sensitive. Transfection of chondrocytes with cognate Egr-1 oligodeoxynucleotides attenuated the ability of TNFalpha to suppress Col2a1, Agc1 or Hapln1 mRNA expression. CONCLUSIONS: Our results suggest that MEK/ERK and Egr1 are required for TNFalpha-regulated catabolic and anabolic genes of the cartilage extracellular matrix, and hence may represent potential targets for drug intervention in osteoarthritis or rheumatoid arthritis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,309
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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