FACS for the isolation of individual cells from transgenic mice harboring a fluorescent protein reporter
Notice bibliographique
Résumé
Flow cytometry is extensively used for the isolation of discreet populations of cells from complex pools. The advent of autofluorescent (AFP) reporters such as wild type Green Fluorescent Protein (wtGFP) (Chalfie et al., 1994) and its variants, including enhanced green fluorescent protein (EGFP) and enhanced yellow fluorescent protein (EYFP) (Cormack et al., 1996), as vital reporters opens up the possibility of sorting live reporter-expressing cells. Moreover the use of these reporters in transgenics (Okabe et al., 1997) or mice carrying homologously targeted loci (Godwin et al., 1998) should enable the direct isolation of reporter-expressing cells from any desired lineage. Here we have assessed this approach in transgenic mice. ES cell-mediated transgenesis was used for generating a line of mice that express an autofluorescent EYFP reporter in the heart and part of the neural tube at midgestation. Pools of fluorescent cells harboring and expressing the EYFP reporter were isolated from defined regions of embryos and their origin confirmed by assaying the expression of domain-defined marker genes. Such a tool should prove useful for gaining access to any given lineage that can be fluorescent protein reporter tagged.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,025 | 0,021 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».