Characterization of a Novel KRAB/C2H2Zinc Finger Transcription Factor Involved in Bone Development
Notice bibliographique
Résumé
Osteogenic differentiation involves a cascade of coordinated gene expression that regulates cell proliferation and matrix protein formation in a defined temporo-spatial manner. Here we have used differential display to identify a novel zinc finger transcription factor (AJ18) that is induced during differentiation of bone cells in vitro and in vivo. The 64-kDa protein, encoded by a 7- kilobase mRNA, contains a Krüppel-associated box (KRAB) domain followed by 11 successive C(2)H(2) zinc finger motifs. AJ18 mRNA, which is also expressed in kidney and brain, is developmentally regulated in embryonic tibiae and calvariae, with little expression in neonate and adult animals. During osteogenic differentiation in vitro AJ18 mRNA is expressed as cells approach confluence and declines as bone formation occurs. Using bacterially expressed, His-tagged AJ18 in a target detection assay, we identified a consensus binding sequence of 5'-CCACA-3', which forms part of the consensus element for Runx2, a master gene for osteogenic differentiation. Overexpression of AJ18 suppressed Runx2-mediated transactivation of an osteocalcin promoter construct in transient transfection assays and reduced alkaline phosphatase activity in bone morphogenetic protein-induced C3H10T1/2 cells. These studies, therefore, have identified a novel zinc finger transcription factor in bone that can modulate Runx2 activity and osteogenic differentiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».