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Enregistrement W2067543002 · doi:10.1111/j.1471-4159.2009.06431.x

Hippocampal seizures alter the expression of the pannexin and connexin transcriptome

2009· article· en· W2067543002 sur OpenAlexafffund
Shanthini Mylvaganam, Liang Zhang, Chiping Wu, Zhang Jane Zhang, Marina Samoilova, James H. Eubanks, Peter L. Carlen, Michael O. Poulter

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSick Kids FoundationNational Alliance for Research on Schizophrenia and Depression
Mots-clésPannexinTranscriptomeConnexinHippocampal formationTetrodotoxinCell biologyGene expressionHippocampusBiologyMessenger RNANeuroscienceGap junctionGeneGeneticsEndocrinologyIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Some forms of seizure activity can be stopped by gap junctional (GJ) blockade. Here, we found that GJ blockers attenuate hippocampal seizure activity induced by a novel seizuregenic protocol using Co(2+). We hypothesized that this activity may occur because of the altered expression of connexin (Cx) and/or pannexin (Panx) mRNAs and protein. We found a 1.5-, 1.4-, and 2-fold increase in Panx1, Panx2, and Cx43 mRNAs, respectively. Significant post-translational modifications of the proteins Cx43 and Panx1 were also observed after the Co(2+) treatment. No changes were observed in the presence of tetrodotoxin, indicating that seizure activity is required for these alterations in expression, rather than the Co(2+) treatment itself. Further analysis of the QPCR data showed that the Cx and Panx transcriptome becomes remarkably re-organized. Pannexin (Panxs 1 and 2) and glial connexin mRNA became highly correlated to one another; suggesting that these genes formed a transcriptomic network of coordinated gene expression, perhaps facilitating seizure induction. These data show that seizure activity up-regulates the expression of both glial and neuronal GJ mRNAs and protein while inducing a high degree of coordinate expression of the GJ transcriptome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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