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Enregistrement W2067574525 · doi:10.1139/g05-041

Identification of proteins induced or upregulated by Fusarium head blight infection in the spikes of hexaploid wheat (<i>Triticum aestivum</i>)

2005· article· en· W2067574525 sur OpenAlexvenueno aff
Wenchun Zhou, F. L. Kolb, Dean E. Riechers

Notice bibliographique

RevueGenome · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyFusariumGlutathione reductaseCultivarInoculationGlutathioneDownregulation and upregulationPlant disease resistancePathogenSuperoxide dismutaseHorticultureBotanyGeneMicrobiologyAntioxidantEnzymeBiochemistryGlutathione peroxidase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium head blight (FHB) caused by Fusarium graminearum is a destructive disease of wheat and barley. It causes economic losses due to reduction in both yield and quality. Although FHB resistance has been well documented and resistant cultivars have been developed to reduce incidence and severity of FHB, there is a limited understanding of the molecular mechanisms involved in plant resistance against the infection and spread of F. graminearum. In the current study, 2-dimensional displays of proteins extracted from wheat spikelets infected with F. graminearum were compared with those from spikelets inoculated with sterile H2O. Fifteen protein spots were detected that were either induced (qualitatively different) or upregulated (quantitatively increased) following F. graminearum infection of spikelets of 'Ning7840', a resistant cultivar. These proteins were identified by LC-MS/MS analysis. Proteins with an antioxidant function such as superoxide dismutase, dehydroascorbate reductase, and glutathione S-transferases (GSTs) were upregulated or induced 5 d after inoculation with F. graminearum, indicating an oxidative burst of H2O2 inside the tissues infected by FHB. An ascorbate-glutathione cycle is likely involved in reduction of H2O2. Expression of proteins with highest similarity to dehydroascorbate reductase and TaGSTF5 (a glutathione S-transferase) differed following FHB infection in susceptible and resistant cultivars. A 14-3-3 protein homolog was also upregulated in FHB-infected spikelets. In addition, a PR-2 protein (beta-1, 3 glucanase) was upregulated in FHB-infected spikes, which is in accord with a previous study that analyzed transcript accumulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations107
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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