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Enregistrement W2067576016 · doi:10.2174/138955708784534481

Activation and Regulation of Toll-like Receptor 9: CpGs and Beyond

2008· review· en· W2067576016 sur OpenAlexaff
Jason Kindrachuk, Jean Potter, Heather L. Wilson, Philip Griebel, Lorne A. Babiuk, Scott Napper

Notice bibliographique

RevueMini-Reviews in Medicinal Chemistry · 2008
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleic acidTLR9Toll-Like Receptor 9BiologyInnate immune systemCpG siteDNAReceptorBiochemistryDNA methylationCell biologyComputational biologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Toll-like receptor 9 has been the focus of considerable research attention for the ability to modulate its activity, and subsequent innate immune responses, through DNA-based immunotherapeutics. Nucleic acids are attractive as therapeutics for their low cost, chemical stability and ease of production. While the ability for TLR9 to be differentially regulated by nucleic acids of varying sequences and structures offers flexibility for immunotherapeutic design, it also necessitates a more comprehensive characterization of these agonists in terms of how these structural parameters correlate with the activation of unique cellular responses. Despite the utilization of TLR9 agonists in human trials these issues have not been adequately addressed. While a wealth of cell stimulation experiments demonstrate the preferential ability for nucleic acids which contain unmethylated cytosine-phosphate-guanine (CpG) motifs to initiate innate immune responses this has not been supported by binding investigations from which largely contradictory information has emerged with respect to the ability of TLR9 to bind nucleic acids in a sequence-dependent fashion. Recent models help to reconcile this apparent contradiction by suggesting that while TLR9 activation is specific for CpG-containing nucleic acids, the receptor binds, and is functionally influenced by, nucleic acids in a sequence-independent fashion. We have proposed a model in which the absolute concentration of nucleic acids modulates the sensitivity of the receptor in a sequence-dependent fashion while activation is specifically achieved by CpG-containing ligands. In this review we reconsider the literature from the perspective of this new appreciation of the functional complexity of TLR9 ligand binding and higher-order regulation with discussion of the implications for immunotherapeutic targeting of TLR9.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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