Photoinduced dissociation of electrospray‐generated ions in an ion trap/time‐of‐flight mass spectrometer using a pulsed CO <sub>2</sub> laser
Notice bibliographique
Résumé
An ion trap/time-of-flight (IT/TOF) mass spectrometer was developed and applied to infrared multiphoton dissociation (IRMPD) studies of ions generated by electrospray ionization. A pulsed 10.6- micro m laser beam from a CO(2) laser was used for excitation of trapped ions. Results from IRMPD of peptide ions show that this method provides useful information related to the amino acid sequence of analyzed peptides. Comparative studies show that IRMPD spectra are similar to those obtained using a 266-nm UV laser beam for excitation. However, in contrast to multiple-pulse excitation required at 266 nm, the energy of a single laser pulse in IRMPD is sufficient to induce dissociation of peptide ions. The laser power is practically an exclusive parameter that must be controlled in order to obtain IRMPD spectra that will provide the optimal structural information. It is further demonstrated that the IRMPD IT/TOF technique has the potential to probe the structural features of larger ions that cannot be readily fragmented by collision-induced dissociation (CID). A multiply charged ion of equine cytochrome c is successfully fragmented in a single laser pulse experiment. The IRMPD IT/TOF technique is also shown to be a promising tool for studying dissociation kinetics of peptide and protein ions. Unlike other methods that usually monitor the dissociation ion kinetics in a dissociation time frame of greater than milliseconds, the IT/TOF can promptly detect all product ions generated by the dissociation process, and thus monitor the dissociation process of peptides and proteins in a sub-millisecond time frame. This instrument allows us to determine the dissociation rates of cytochrome c ions using high-energy photoexcitation. It is found that the charge state of the protein ion has a significant effect on dissociation kinetics, which is consistent with that found under low-energy excitation experiments. It is shown that the increase in energy of a laser pulse from 130 to 180 mJ changes the dissociation rate constant for the +12 ion from k = 2.4 x 10(3) x s(-1) to k = 7.3 x 10(4) x s(-1). The +8 ion following excitation at 130 mJ dissociates slower with a rate constant of k = 2.6 x 10(2) x s(-1). The rate difference observed is attributed to conformational differences among the ions with different charge states.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».