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Enregistrement W2067663670 · doi:10.1186/1742-4690-11-s1-o72

HTLV-3 and HTLV-4 antisense proteins enhance the transactivation potential of several Jun family members through interaction via their bZIP-like domain

2014· article· en· W2067663670 sur OpenAlexaff
Émilie Larocque, Charlotte André‐Arpin, Jean-Michel Mesnard, William M. Switzer, Benoı̂t Barbeau

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransactivationTranscription (linguistics)Leucine zipperbZIP domainTranscription factorBiologyDNA-binding proteinGeneMutantPromoterGeneticsMolecular biologyCell biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HTLV-3 and HTLV-4 are two recently identified viruses closely related to HTLV-1, which have not yet been linked to any diseases. Similarly to HTLV-1 and HTLV-2, which both express antisense transcript-derived HBZ and APH-2, respectively, HTLV-3 and HTLV-4 harbor antisense genes termed APH-3 and APH-4. These two encoded proteins contain an atypical bZIP domain but are still able to down-regulate Tax-mediated LTR activation, alike HBZ and APH-2. Since HBZ and APH-2 affect Jun-dependent transcription differently, our goal was to assess the impact of APH-3 and APH-4 on the transactivation potential of Jun family members. Co-IP experiments first showed that both APH-3 and APH-4 interacted with all tested Jun members. Jun/APH complexes significantly enhanced Jun-dependent transactivation of the human collagenase promoter containing a single AP-1 binding site as well as a construct bearing a minimal promoter and AP-1-binding sites. APH-3 and APH-4 deletion mutants and point mutations of specific leucine residues demonstrated that this functional interaction was mediated by the bZIP-like domain. Using a construct with a minimal promoter bearing GAL4-binding sites and APH-3/APH-4 expression vectors fused to the GAL4 DNA binding domain, we further showed that, in contrast to HBZ, APH-3 and APH-4 did not contain an activation domain. These results highlight the varying capacity of different HTLV-encoded antisense proteins to act upon transactivation mediated by Jun transcription factors. Taking into account the previously reported association between HBZ and ATL development, determining the functional differences of these HTLV antisense proteins could contribute in better understanding this association.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,195
Score d'incertitude au seuil0,709

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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