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Enregistrement W2067678115 · doi:10.1111/j.1460-9568.2004.03275.x

Temporal and spatial expression patterns of canonical clock genes and clock‐controlled genes in the suprachiasmatic nucleus

2004· article· en· W2067678115 sur OpenAlexfundno aff
Toshiyuki Hamada, Michael C. Antle, Rae Silver

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neuroscience · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésPER1Suprachiasmatic nucleusPER2CLOCKCircadian rhythmBiologyCircadian clockLight effects on circadian rhythmCell biologyGene expressionCalbindinInternal medicineNeuroscienceEndocrinologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In mammals, the suprachiasmatic nuclei (SCN) of the hypothalamus control endogenous circadian rhythms and entrainment to the environment. A core SCN region of calbindin (CalB)-containing cells is retinorecipient and the cells therein lack rhythmic expression of clock genes and electrical activity. The core is surrounded by a 'shell' of rhythmic oscillator cells. In the present experiments, we studied the spatial arrangement of oscillator cells by examining the spatial and temporal patterns of expression of the canonical clock genes Per1, Per2 and vasopressin mRNA, a clock-controlled gene. Surprisingly, in the SCN shell, the dorsomedial cells were the first to rhythmically express both Per1 and VP mRNA, with gene expression then spreading very slowly through much of the nucleus for the next 12 h then receding to baseline levels. Following a light pulse, Per expression increased after 1 h in the core SCN and after 1.5 h in the shell. Although expression in the shell occurred earlier in light-pulsed animals than in those housed in constant darkness, it still followed the same spatial and temporal expression pattern as was observed in constant darkness. The results suggest that not only is the SCN organized into light-responsive and rhythmic regions but also that the rhythmic region of the SCN itself has an ordered arrangement of SCN oscillator cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations125
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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