Polymorphic Microsatellite Markers for Genetic Analysis of Collagen Genes in Suspected Collagenopathies in Dogs
Notice bibliographique
Résumé
Defects in collagen proteins cause a variety of disorders in humans. It can be expected that collagen gene mutations are involved in collagenopathies in dogs. The collagen genes COL3A1, COL5A1, COL5A2, COL6A1, COL6A3, COL9A1, COL9A2, COL9A3, COL10A1 and COL11A1 were identified on the canine genome based on the homology with the human genes. Simple sequence repeats (microsatellites) were found in the chromosomal regions of these genes and investigated for polymorphism in Labrador Retrievers, Bernese Mountain dogs, Boxer dogs and German Shepherd dogs by PCR and subsequent detection of the DNA products. Nine informative microsatellite markers were identified. The markers closely situated to COL9A1, COL9A2 and COL9A3 were used to investigate the involvement of the genes in cranial cruciate ligament rupture in Boxer dogs. It was found that these genes are probably not involved in this abnormality. The markers described here will be useful for a candidate gene approach of suspected collagenopathies specific to dog breeds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».