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Enregistrement W2067741540 · doi:10.1023/b:boli.0000045759.12935.76

Assessing the severity of the small inframe deletion mutation in the α‐subunit of β‐hexosaminidase A found in the Turkish population by reproducing it in the more stable β‐subunit

2004· article· en· W2067741540 sur OpenAlexafffund
Michael B. Tropak, Don J. Mahuran, H. Asuman Özkara

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProtein subunitBiologyMutationMolecular biologyMutantGeneticsExonPopulationHexosaminidaseGeneBiochemistryEnzymeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GM(2) gangliosidoses are a group of panethnic lysosomal storage diseases in which GM(2) ganglioside accumulates in the lysosome due to a defect in one of three genes, two of which encode the alpha- or beta-subunits of beta- N -acetylhexosaminidase (Hex) A. A small inframe deletion mutation in the catalytic domain of the alpha-subunit of Hex has been found in five Turkish patients with infantile Tay-Sachs disease. To date it has not been detected in other populations and is the only mutation to be found in exon 10. It results in detectable levels of inactive alpha-protein in its precursor form. Because the alpha- and beta-subunits share 60% sequence identity, the Hex A and Hex B genes are believed to have arisen from a common ancestral gene. Thus the subunits must share very similar three-dimensional structures with conserved functional domains. Hex B, the beta-subunit homodimer is more stable than the heterodimeric Hex A, and much more stable than Hex S, the alpha homodimer. Thus, mutations that completely destabilize the alpha-subunit can often be partially rescued if expressed in the aligned positions in the beta-subunit. To better understand the severity of the Turkish HEXA mutation, we reproduced the 12 bp deletion mutation (1267-1278) in the beta-subunit cDNA. Western blot analysis of permanently transfected CHO cells expressing the mutant detected only the pro-form of the beta-subunit coupled with a total lack of detectable Hex B activity. These data indicate that the deletion of the four amino acids severely affects the folding of even the more stable beta-subunit, causing its retention in the endoplasmic reticulum and ultimate degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,217
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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