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Enregistrement W2067803190 · doi:10.1186/1753-6561-3-s7-s44

Using a latent growth curve model for an integrative assessment of the effects of genetic and environmental factors on multiple phenotypes

2009· article· en· W2067803190 sur OpenAlexafffund
Jemila S. Hamid, Nicole M. Roslin, Andrew D. Paterson, Joseph Beyene

Notice bibliographique

RevueBMC Proceedings · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of TorontoInstitute for Clinical Evaluative SciencesSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario GenomicsMitacsNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesOntario Genomics Institute
Mots-clésPhenotypeFramingham Heart StudyMedicineCovariateMultivariate statisticsGrowth curve (statistics)Framingham Risk ScoreCohortCoronary heart diseaseQuantitative trait locusDemographyInternal medicineBioinformaticsStatisticsDiseaseGeneticsBiologyEnvironmental healthGeneMathematicsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We propose the use of latent growth curve model to assess the influence of genetic, environmental, demographic, and lifestyle factors on multiple phenotypes related to coronary heart disease. We model four quantitative traits (systolic blood pressure, high-density lipoprotein, low-density lipoprotein, and triglycerides) simultaneously in a multivariate framework that allows us to study their change over time, assess individual variation, and investigate cross-phenotype relationships. Environmental, demographic, and lifestyle covariates are included at different levels of the model as time-varying or time-invariant, as appropriate. To investigate the change over time attributed to genetic factors, we use candidate markers that have previously been shown to be associated with the quantitative traits. We illustrate our approach using independent observations from the offspring cohort of the Framingham Heart Study data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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