Potent Lectin-Independent Chaperone Function of Calnexin under Conditions Prevalent within the Lumen of the Endoplasmic Reticulum
Notice bibliographique
Résumé
Calnexin is a membrane-bound chaperone of the endoplasmic reticulum (ER) that participates in the folding and quality control of newly synthesized glycoproteins. Binding to glycoproteins occurs through a lectin site with specificity for Glc1Man9GlcNAc2 oligosaccharides as well as through a polypeptide binding site that recognizes non-native protein conformations. The latter interaction is somewhat controversial because it is based on observations that calnexin can suppress the aggregation of non-glycosylated substrates at elevated temperature or at low calcium concentrations, conditions that may affect the structural integrity of calnexin. Here, we examine the ability of calnexin to interact with a non-glycosylated substrate under physiological conditions of the ER lumen. We show that the soluble ER luminal domain of calnexin can indeed suppress the aggregation of non-glycosylated firefly luciferase at 37 degrees C and at the normal resting ER calcium concentration of 0.4 mM. However, gradual reduction of calcium below the resting level was accompanied by a progressive loss of native calnexin structure as assessed by thermal stability, protease sensitivity, intrinsic fluorescence, and bis-ANS binding. These assays permitted the characterization of a single calcium binding site on calnexin with a Kd = 0.15 +/- 0.05 mM. We also show that the suppression of firefly luciferase aggregation by calnexin is strongly enhanced in the presence of millimolar concentrations of ATP and that the Kd for ATP binding to calnexin in the presence of 0.4 mM calcium is 0.7 mM. ATP did not alter the overall stability of calnexin but instead triggered the localized exposure of a hydrophobic site on the chaperone. These findings demonstrate that calnexin is a potent molecular chaperone that is capable of suppressing the aggregation of substrates through polypeptide-based interactions under conditions that exist within the ER lumen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».