Abstract 4636: AMF-1c-120: an antibody specific for misfolded prion protein expressed on ovarian cancer cells.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We tested the hypothesis that cancer cells might display misfolded protein molecules at the cell surface, due to oxidative covalent modifications, defective glycosylation, and/or other factors relevant to cancer. We developed a computational algorithm to predict regions of proteins which were most likely to undergo loss of structure and resemble free unstructured peptides against which antibodies could be generated and screened. Antibodies directed against these misfolding-prone regions, termed disease-specific epitopes (DSEs), are therefore expected to recognize cancer cells while sparing natively folded proteins on healthy cells. We have applied this strategy to develop an antibody that is specific for ovarian cancer cells, which does not bind to normal ovarian epithelium. Using the ProMIS™ computational algorithm to predict unstable regions in proteins, three DSEs in the prion protein (PrP) were identified. Ultra-high sensitivity antibodies are required for binding to isolated misfolded protein molecules at the cell surface, and thus rabbits were immunized with peptides corresponding to the PrP DSE sequences and rabbit monoclonal anti-peptide antibodies were generated. One antibody, AMF-1c-120, has sub-nanomolar binding affinity for denatured PrP, but does not bind to native PrP. AMF-1c-120 binds to four ovarian tumor cell lines and one ovarian tumor implanted and propagated in mice, but does not bind to normal ovarian epithelial cells. Proteinase K sensitivity of the AMF-1c-120 epitope is consistent with partial denaturation of PrP at the cell surface of ovarian cancer cell lines. Preclinical efficacy studies are in progress to investigate the anti-tumor effects of AMF-1c-120. Citation Format: Marni D. Uger, Viengthong Chai, Veronica Ciolfi, Hui Chen, Ewa Plawinski, Tapfuma Mutukura, Andrew Sage, Ryan Demers, Leo Lau, Pierre Lee, Xiuwen Liu, Jun Guan, Yuzhuo Wang, William C. Guest, Steven S. Plotkin, Neil R. Cashman. AMF-1c-120: an antibody specific for misfolded prion protein expressed on ovarian cancer cells. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 4636. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-4636
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».