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Functional significance of globotriaosyl ceramide in interferon-?2/type 1 interferon receptor-mediated antiviral activity

2000· article· en· W2068044512 sur OpenAlexafffund
Aye‐Aye Khine, Clifford A. Lingwood

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Physiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilHospital for Sick Children
Mots-clésBiologyAlpha interferonInterferonSignal transductionMolecular biologyG alpha subunitCeramideInterferon type IReceptorProtein subunitBiochemistryVirologyApoptosisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The N-terminus of the type 1 interferon receptor subunit, IFNAR1, has high amino acid sequence similarity to the receptor binding B subunit of the Escherichia coli-derived verotoxin 1, VT1. The glycolipid, globotriaosyl ceramide (Gb(3): Gal alpha(1) --> 4 Gal beta 1 --> 4 Glu beta 1 --> 1 Cer) is the specific cell receptor for VT1. Gb(3)-deficient variant cells selected for VT resistance are cross-resistant to interferon-alpha (IFN-alpha)-mediated antiproliferative activity. The association of eIFNAR1 with Gal alpha 1 --> 4 Gal containing glycolipids has been previously shown to be important for the receptor-mediated IFN-alpha signal transduction for growth inhibition. The crucial role of Gb(3) for the signal transduction of IFN-alpha-mediated antiviral activity is now reported. IFN-alpha-mediated antiviral activity, nuclear translocation of activated Stat1, and increased expression of PKR were defective in Gb(3)-deficient vero mutant cells, although the surface expression of IFNAR1 was unaltered. The VT1B subunit was found to inhibit IFN-alpha-mediated antiviral activity, Stat1 nuclear translocation and PKR upregulation. Unlike VT1 cytotoxicity, IFN-alpha-induced Stat1 nuclear translocation was not inhibited when RME was prevented, suggesting that the accessory function of Gb(3) occurs at the plasma membrane. IFN-alpha antiviral activity was also studied in Gb(3)-positive MRC-5 cells, which are resistant to IFN-alpha growth inhibition, partially resistant to VT1 but still remain fully sensitive to IFN-alpha antiviral activity, and two astrocytoma cell lines expressing different Gb(3) fatty acid isoforms. In both systems, long chain fatty acid-containing Gb(3) isoforms, which are less effective to mediate VT1 cytotoxicity, were found to correlate with higher IFN-alpha-mediated antiviral activity. Inhibition of Gb(3) synthesis in toto prevented IFN-alpha antiviral activity in all cells. We propose that the long chain Gb(3) fatty isoforms preferentially remain in the plasma membrane, and by associating with IFNAR1, mediate IFN-alpha antiviral signaling, whereas short chain Gb(3) fatty acid isoforms are preferentially internalized to mediate VT1 cytotoxicity and IFNAR1-dependent IFN-alpha growth inhibition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,607

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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