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Enregistrement W2068045710 · doi:10.1186/1471-2180-7-69

Involvement of the YneS/YgiH and PlsX proteins in phospholipid biosynthesis in both Bacillus subtilis and Escherichia coli

2007· article· en· W2068045710 sur OpenAlex
Mika Yoshimura, Taku Oshima, Naotake Ogasawara

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceInstitute of GeneticsRikkyo UniversityMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésBacillus subtilisBiologyEscherichia coliGeneBiochemistryBiosynthesisPhospholipidGenomeAcyltransferaseBacteriaMicrobiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Phospholipid biosynthesis commences with the acylation of glycerol-3-phosphate (G3P) to form 1-acyl-G3P. This step is catalyzed by the PlsB protein in Escherichia coli. The gene encoding this protein has not been identified, however, in the majority of bacterial genome sequences, including that of Bacillus subtilis. Recently, a new two-step pathway catalyzed by PlsX and PlsY proteins for the initiation of phospholipid formation in Streptococcus pneumoniae has been reported. RESULTS: In B. subtilis, 271 genes have been reported to be indispensable, when inactivated singly, for growth in LB medium. Among these, 11 genes encode proteins with unknown functions. As part of a genetic study to identify the functions of these genes, we show here that the B. subtilis ortholog of S. pneumoniae PlsY, YneS, is required for G3P acyltransferase activity, together with PlsX. The B. subtilis genome lacks plsB, and we show in vivo that the PlsX/Y pathway is indeed essential for the growth of bacteria lacking plsB. Interestingly, in addition to plsB, E. coli possesses plsX and the plsY ortholog, ygiH. We therefore explored the functional relationship between PlsB, PlsX and YgiH in E. coli, and found that plsB is essential for E. coli growth, indicating that PlsB plays an important role in 1-acyl-G3P synthesis in E. coli. We also found, however, that the simultaneous inactivation of plsX and ygiH was impossible, revealing important roles for PlsX and YgiH in E. coli growth. CONCLUSION: Both plsX and yneS are essential for 1-acyl-G3P synthesis in B. subtilis, in agreement with recent reports on their biochemical functions. In E. coli, PlsB plays a principal role in 1-acyl-G3P synthesis and is also essential for bacterial growth. PlsX and YgiH also, however, play important roles in E. coli growth, possibly by regulating the intracellular concentration of acyl-ACP. These proteins are therefore important targets for development of new antibacterial agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,456

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle