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Enregistrement W2068075375 · doi:10.1016/j.clpt.2003.10.006

A novel functional polymorphism in the uridine diphosphate–glucuronosyltransferase 2B7 promoter with significant impact on promoter activity

2004· article· en· W2068075375 sur OpenAlexaff
Yannick Duguay, Cecilie Báár, Frank Skorpen, Chantal Guillemette

Notice bibliographique

RevueClinical Pharmacology & Therapeutics · 2004
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismUGT2B7MorphineGlucuronosyltransferaseGlucuronideChemistryUridineInternal medicineGlucuronidationBiologyPharmacologyGenotypeBiochemistryMedicineIn vitroGeneMetabolismRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To clarify the molecular determinants of the metabolic variability of morphine, we searched for genetic polymorphisms in the gene for uridine diphosphate-glucuronosyltransferase 2B7 (UGT2B7) and evaluated their functional impact in vitro and in patients with cancer receiving long-term morphine therapy. Genetic analysis revealed the existence of 8 single-nucleotide polymorphisms (SNPs), 6 of which are tightly linked and are at positions -1248, -1241, -1054, -842, -268, and -102 relative to the hepatic start site. In contrast, an SNP at position -66 occurs independently, whereas a novel variation at position -79 appears to be in linkage disequilibrium with the codon 268 SNP (UGT2B7*2). At least 4 haplotypes were observed in white subjects included in the initial SNP screening. On functional in vitro characterization, promoter-reporter gene constructs with the -79 variation displayed 2.5- to 7-fold less activity compared with the wild-type construct in Caco-2 colon cells and HepG2 hepatoma cells, respectively (P =.015 and P <.001, respectively). To investigate a possible effect of the -79 variation in vivo, serum morphine and morphine glucuronide concentrations were measured by liquid chromatography-mass spectrometry in patients with cancer who received long-term oral morphine therapy, and subjects were then genotyped for the -79 polymorphism. Among 175 patients with normal hepatic and renal function, 6 were heterozygous for the -79 variation, and the morphine-6-glucuronide (M6G)/morphine and morphine-3-glucuronide (M3G)/morphine ratios versus those in the 169 noncarriers were 5.9 +/- 3.5 versus 7.1 +/- 7.0 for M6G/morphine (P =.96) and 31.2 +/- 17.1 versus 42.9 +/- 31.2 for M3G/morphine (P =.53), respectively. Further studies in larger samples are needed to make conclusions about the possible clinical relevance of the -79 polymorphism in the UGT2B7 gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,207
Tête enseignante GPT0,472
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations149
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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