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Evidence that breast cancer risk at the 2q35 locus is mediated through IGFBP5 regulation
Maya Ghoussaini, Stacey L. Edwards, Kyriaki Michailidou, Silje Nord, Richard Cowper‐Sal·lari, Kinjal Desai, Siddhartha Kar, Kristine M. Hillman, Susanne Kaufmann, Dylan M. Glubb, Jonathan Beesley, Joe Dennis, Manjeet K. Bolla, Qin Wang, Ed Dicks, Qi Guo, Marjanka K. Schmidt, Mitul Shah, Robert Luben, Judith Brown, Kamila Czene, Hatef Darabi, Mikael Eriksson, Daniel Klevebring, Stig E. Bojesen, Børge G. Nordestgaard, Sune F. Nielsen, Henrik Flyger, Diether Lambrechts, Bernard Thienpont, Patrick Neven, Hans Wildiers, Annegien Broeks, Laura J. van’t Veer, Emiel J. Rutgers, Fergus J. Couch, Janet E. Olson, Emily Hallberg, Celine M. Vachon, Jenny Chang‐Claude, Anja Rudolph, Petra Seibold, Dieter Flesch‐Janys, Julian Peto, Isabel dos‐Santos‐Silva, Lorna J. Gibson, Heli Nevanlinna, Taru Muranen, Kristiina Aittomäki, Carl Blomqvist, Per Hall, Jingmei Li, Jianjun Liu, Keith Humphreys, Daehee Kang, Ji‐Yeob Choi, Sue K. Park, Dong‐Young Noh, Keitaro Matsuo, Hidemi Ito, Hiroji Iwata, Yasushi Yatabe, Pascal Guénel, Thérèse Truong, F. Ménégaux, Barbara Burwinkel, Frederik Marmé, Andreas Schneeweiß, Christof Sohn, Anna H. Wu, Chiu-Chen Tseng, David Van Den Berg, Daniel O. Stram, Javier Benı́tez, M. Pilar Zamora, José Ignacio Arias Pérez, Primitiva Menéndez, Xiao‐Ou Shu, Wei Lu, Yu-Tang Gao, Qiuyin Cai, Angela Cox, Simon S. Cross, Malcolm Reed, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, Gord Glendon, Sandrine Tchatchou, Elinor J. Sawyer, Ian Tomlinson, Michael J. Kerin, Nicola Miller, Christopher A. Haiman, Brian E. Henderson, Fredrick R. Schumacher, Loı̈c Le Marchand, Annika Lindblom, Sara Margolin, Soo‐Hwang Teo, Cheng Har Yip, Daphne S. C. Lee, Tien Yin Wong, Maartje J. Hooning, John W.M. Martens, J. Margriet Collée, Carolien H. M. van Deurzen, John L. Hopper, Melissa C. Southey, Helen Tsimiklis, Miroslav Kapuscinski, Chen‐Yang Shen, Pei-Ei Wu, Jyh-Cherng Yu, Shou-Tung Chen, Grethe Grenaker Alnæs, Anne‐Lise Børresen‐Dale, Graham G. Giles, Roger L. Milne, Catriona McLean, Kenneth Muir, Artitaya Lophatananon, Sarah Stewart‐Brown, Pornthep Siriwanarangsan, Mikael Hartman, Hui Miao, Shaik Ahmad Buhari, Yik Ying Teo, Peter A. Fasching, Lothar Haeberle, Arif B. Ekici, Matthias W. Beckmann, Hermann Brenner, Aida Karina Dieffenbach, Volker Arndt, Christa Stegmaier, Anthony J. Swerdlow, Alan Ashworth, Nick Orr, Minouk J. Schoemaker, Montserrat García‐Closas, Jonine D. Figueroa, Stephen J. Chanock, Jolanta Lissowska, Jacques Simard, Mark S. Goldberg, France Labrèche, Martine Dumont, Robert Winqvist, Katri Pylkäs, Arja Jukkola‐Vuorinen, Hiltrud Brauch, Thomas Brüning, Yon-Dschun Koto, Paolo Radice, Paolo Peterlongo, Bernardo Bonanni, Sara Volorio, Thilo Dörk, Natalia Bogdanova, Sonja Helbig, Vesa Kataja, Veli-Matti Kosma, Jaana M. Hartikainen, Peter Devilee, Robert A.E.M. Tollenaar, Caroline Seynaeve, Christi J. van Asperen, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska–Bieniek, Katarzyna Durda, Susan Slager, Amanda E. Toland, Christine B. Ambrosone, Drakoulis Yannoukakos, Suleeporn Sangrajrang, Valérie Gaborieau, Paul Brennan, James McKay, Ute Hamann, Diana Torres, Wei Zheng, Jirong Long, Hoda Anton‐Culver, Susan L. Neuhausen, Craig Luccarini, Caroline Baynes, Shahana Ahmed, Mel Maranian, Catherine S. Healey, Anna González‐Neira, Guillermo Pita, M. Rosario Alonso, Núria Álvarez, Daniel Herrero, Daniel C. Tessier, Daniel Vincent, François Bacot, Inês de Santiago, Jason S. Carroll, Carlos Caldas, Melissa A. Brown, Mathieu Lupien, Vessela N. Kristensen, Paul D.P. Pharoah, Georgia Chenevix‐Trench, Juliet D. French, Douglas F. Easton, Alison M. Dunning, David D.L. Bowtell, Anna de Fazio
Notice bibliographique
RevueNature Communications · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversité de MontréalSante MontrealMcGill UniversityMcGill University Health CentreUniversité LavalOntario Institute for Cancer ResearchPublic Health OntarioCentre hospitalier universitaire de QuébecRoyal Victoria HospitalUniversity Health NetworkUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteInstitute of Biomedical Sciences, Academia SinicaUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfBiomedical Research CouncilInstituto de Salud Carlos IIIMedical Research CouncilNational Institutes of HealthMinistero dello Sviluppo EconomicoAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailNational Health and Medical Research CouncilOulun YliopistoDeutsche KrebshilfeMedizinischen Hochschule HannoverInstitut National Du CancerLeids Universitair Medisch CentrumKWF KankerbestrijdingLigue Contre le CancerKarolinska InstitutetNational Medical Research CouncilMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoMinistry of Education, Science and TechnologyBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadCanadian Institutes of Health ResearchGeneral Secretariat for Research and TechnologyRobert Bosch StiftungKementerian Sains, Teknologi dan InovasiKing's College LondonAcademy of FinlandCancer AustraliaAgence Nationale de la RechercheFonds Wetenschappelijk OnderzoekCancerfondenStockholms Läns LandstingSingapore Eye Research InstituteNational Breast Cancer FoundationEuropean CommissionKuopion Yliopistollinen SairaalaAcademia SinicaNational Institute for Health and Care ResearchRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnBreast Cancer Research TrustWellcome TrustFondation du cancer du sein du QuébecNorges ForskningsrådQIMR Berghofer Medical Research InstituteItä-Suomen YliopistoMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationLon V. Smith FoundationEuropean Social FundAgency for Science, Technology and ResearchNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungMcGill University Health CentreUniversity of California, IrvineDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationDeutsches KrebsforschungszentrumBreast Cancer Research FoundationMcGill UniversityHerlev HospitalWorld Health OrganizationAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroMinistry of Public HealthBeckman Research Institute, City of HopeUniversity of Southern CaliforniaCancer Research UKSusan G. Komen for the CureTaiwan BiobankSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådCancer Council VictoriaCalifornia Department of Public HealthHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriUniversity of CambridgeFondation de FranceCalifornia Breast Cancer Research ProgramNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismLocus (genetics)Genome-wide association studyAlleleGeneticsBiologyBreast cancerOdds ratioHaplotypeSNPGenotypeGenetic associationEnhancer1000 Genomes ProjectGenotypingGeneCancerMedicineInternal medicineTranscription factor
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations121
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentnon