Molecular, morphological, and cytological analysis of diverse<i>Brachypodium distachyon</i>inbred lines
Notice bibliographique
Résumé
Brachypodium distachyon (brachypodium) is a small grass with the biological and genomic attributes necessary to serve as a model system for all grasses including small grains and grasses being developed as energy crops (e.g., switchgrass and Miscanthus). To add natural variation to the toolkit available to plant biologists using brachypodium as a model system, it is imperative to establish extensive, well-characterized germplasm collections. The objectives of this study were to collect brachypodium accessions from throughout Turkey and then characterize the molecular (nuclear and organelle genome), morphological, and cytological variation within the collection. We collected 164 lines from 45 diverse geographic regions of Turkey and created 146 inbred lines. The majority of this material (116 of 146 inbred lines) was diploid. The similarity matrix for the diploid lines based on AFLP analysis indicated extensive diversity, with genetic distances ranging from 0.05 to 0.78. Organelle genome diversity, on the other hand, was low both among and within the lines used in this study. The geographic distribution of genotypes was not significantly correlated with either nuclear or organelle genome variation for the genotypes studied. Phenotypic characterization of the lines showed extensive variation in flowering time (7-22 weeks), seed production (4-193 seeds/plant), and biomass (15-77 g). Chromosome morphology of the collected brachypodium accessions varied from submetacentric to metacentric, except for chromosome 5, which was acrocentric. The diverse brachypodium lines developed in this study will allow experimental approaches dependent upon natural variation to be applied to this new model grass. These results will also help efforts to have a better understanding of complex large genomes (i.e., wheat, barley, and switchgrass).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».