MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2068289427 · doi:10.1074/jbc.m113.464750

Batroxobin Binds Fibrin with Higher Affinity and Promotes Clot Expansion to a Greater Extent than Thrombin

2013· article· en· W2068289427 sur OpenAlex
Trang T. Vu, Alan R. Stafford, Beverly A. Leslie, Paul Y. Kim, James C. Fredenburgh, Jeffrey I. Weitz

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood properties and coagulation
Établissements canadiensMcMaster UniversityHamilton Health SciencesThrombosis and Atherosclerosis Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBatroxobinFibrinThrombinFibrinogenChemistrySerine proteaseDiscovery and development of direct thrombin inhibitorsBiochemistryImmunologyBiologyProteasePlateletEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Batroxobin is a thrombin-like serine protease from the venom of Bothrops atrox moojeni that clots fibrinogen. In contrast to thrombin, which releases fibrinopeptide A and B from the NH 2 -terminal domains of the Aα- and Bβ-chains of fibrinogen, respectively, batroxobin only releases fibrinopeptide A. Because the mechanism responsible for these differences is unknown, we compared the interactions of batroxobin and thrombin with the predominant γ A /γ A isoform of fibrin(ogen) and the γ A /γ′ variant with an extended γ-chain. Thrombin binds to the γ′-chain and forms a higher affinity interaction with γ A /γ′-fibrin(ogen) than γ A /γ A -fibrin(ogen). In contrast, batroxobin binds both fibrin(ogen) isoforms with similar high affinity ( K d values of about 0.5 μm) even though it does not interact with the γ′-chain. The batroxobin-binding sites on fibrin(ogen) only partially overlap with those of thrombin because thrombin attenuates, but does not abrogate, the interaction of γ A /γ A -fibrinogen with batroxobin. Furthermore, although both thrombin and batroxobin bind to the central E-region of fibrinogen with a K d value of 2–5 μm, the α(17–51) and Bβ(1–42) regions bind thrombin but not batroxobin. Once bound to fibrin, the capacity of batroxobin to promote fibrin accretion is 18-fold greater than that of thrombin, a finding that may explain the microvascular thrombosis that complicates envenomation by B. atrox moojeni . Therefore, batroxobin binds fibrin(ogen) in a manner distinct from thrombin, which may contribute to its higher affinity interaction, selective fibrinopeptide A release, and prothrombotic properties. Background: Snake venom protease batroxobin clots fibrinogen in a manner distinct from thrombin. Results: Batroxobin binds fibrin(ogen) with higher affinity than thrombin and promotes greater clot expansion. Conclusion: Batroxobin's distinctive interaction with fibrin(ogen) may contribute to its unique pattern of fibrinopeptide release. Significance: Clinically, batroxobin is used as a defibrinogenating agent, but its capacity to promote clot expansion may promote microvascular thrombosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,473
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle