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Enregistrement W2068411420 · doi:10.1371/journal.pone.0054280

Ultrashort Cationic Lipopeptides and Lipopeptoids Selectively Induce Cytokine Production in Macrophages

2013· article· en· W2068411420 sur OpenAlexafffund
Brandon Findlay, Neeloffer Mookherjee, Frank Schweizer

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensHealth Sciences CentreManitoba HealthUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCathelicidinCytokineChemokineIn vivoChemistryProteaseBiochemistryMicrobiologyBiologyPeptideImmunologyAntimicrobial peptidesEnzymeReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A series of ultrashort lipopeptides and lipopeptoids were tested for their ability to induce cytokine production in macrophages. Fourteen compounds were found to strongly induce production of chemokines Groα and IL-8, with a structural bias that was absent from previous antibacterial activity investigations. Compounds based on LysGlyLys and NLysGlyNLys sequences did not induce cytokine production, whereas those based on LysLysLys and NLysNLysNLys were active only when linked to a lipid tail at least sixteen carbons long. Three lipopeptides induced high levels of IL-8 production, above that of equivalent concentrations of cathelicidin LL-37, while no compound induced production of the pro-inflammatory cytokine TNF-α at or below 100 µM. Two compounds, peptoids C16OH-NLysNLysNLys and C16OH-NHarNHarNHar, were selective for IL-8 production and did not induce TNF-α or IL-1β. These compounds may prove beneficial for in vivo treatment of infectious disease, with improved bioavailability over LL-37 due to their protease-resistant scaffold.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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