Disruption of the glycolate dehydrogenase gene in the high-CO<sub>2</sub>-requiring mutant HCR89 of<i>Chlamydomonas reinhardtii</i>
Notice bibliographique
Résumé
One of the most notable contrasts between the photorespiratory pathway of higher plants and that of many of the green algae including Chlamydomonas reinhardtii lies in the enzymes that serve for oxidation of glycolate to glyoxylate. The gene disrupted by insertional mutagenesis in a high-CO2-requiring mutant, HCR89, of C. reinhardtii was determined to encode glycolate dehydrogenase (EC 1.1.99.14), which serves as the counterpart of glycolate oxidase (EC 1.1.3.15) in classical higher plant photorespiration. Neither glycolate nor D-lactate oxidation from the membrane fraction of HCR89 was detected. Excretion of over-accumulated glycolate into media due to the absence of glycolate dehydrogenase activity was observed for HCR89 under both high- and low-CO2conditions. Chlamydomonas glycolate dehydrogenase, CrGDH, with a molecular mass of 118 851 Da, comprises a relatively hydrophobic N-terminal region, a FAD-containing domain homologous to the D subunit of the glycolate oxidase complex from Escherischia coli, and an ironsulfur cluster containing domain homologous to the C subunit of anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase complex from Escherichia coli. The second Cys residue in the second ironsulfur cluster motif of CrGDH is replaced by Asp, as CxxDxxCxxxCP, indicating the second ironsulfur cluster coordinates most likely 3Fe4S instead of 4Fe4S. The membrane association of the glycolate dehydrogenase activity agrees with three predicted transmembrane regions on the ironsulfur domain.Key words: algae, Chlamydomonas, CO2, glycolate, lactate, mitochondria, photorespiration, photosynthesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».