A Novel PTB-PDZ Domain Interaction Mediates Isoform-specific Ubiquitylation of Mammalian Numb
Notice bibliographique
Résumé
LNX was originally cloned as a Numb PTB-binding molecule, and it was subsequently found to act as a RING finger-type E3 ubiquitin ligase for the ubiquitylation and degradation of mNumb. Numb is a PTB domain-containing protein that functions as an intrinsic determinant of cell fate in asymmetric cell division. In mammals, four protein isoforms arise from alternative mRNA splicing. Here we report that while all four protein isoforms bind to LNX, only p72 and p66 Numb isoforms are ubiquitylated and degraded. The p72 and p66 Numb proteins differ from the other two isoforms by the presence of an 11-amino acid sequence insert in the PTB domain (PTBi). We demonstrate that the isoform-specific ubiquitylation of mNumb is due to a novel interaction between the first PDZ domain (PDZ1) of LNX and the PTBi variant. Deletion of LNX PDZ1 domain resulted in loss of ubiquitylation and subsequent degradation of the PTBi form of Numb. Interestingly efficient PTBi ubiquitylation not only depends on association with the LNX PDZ1 domain but also requires binding to the canonical PTB-binding motif NPAY in LNX. Thus two distinct modes of PTBi-mediated interaction with LNX work in concert to allow the effective and specific degradation of the p72 and p66 isoforms of mNumb.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».