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Enregistrement W2068572301 · doi:10.1371/journal.pone.0021265

Predicting Species Diversity of Benthic Communities within Turbid Nearshore Using Full-Waveform Bathymetric LiDAR and Machine Learners

2011· article· en· W2068572301 sur OpenAlexafffundabout
Antoine Collin, Philippe Archambault, Bernard Long

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensUniversité du Québec à RimouskiInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésBathymetryLidarBenthic zoneEcologyAbundance (ecology)OceanographySpecies richnessRange (aeronautics)Environmental scienceSpecies diversityGeographyGeologyRemote sensingBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epi-macrobenthic species richness, abundance and composition are linked with type, assemblage and structural complexity of seabed habitat within coastal ecosystems. However, the evaluation of these habitats is highly hindered by limitations related to both waterborne surveys (slow acquisition, shallow water and low reactivity) and water clarity (turbid for most coastal areas). Substratum type/diversity and bathymetric features were elucidated using a supervised method applied to airborne bathymetric LiDAR waveforms over Saint-Siméon-Bonaventure's nearshore area (Gulf of Saint-Lawrence, Québec, Canada). High-resolution underwater photographs were taken at three hundred stations across an 8-km(2) study area. Seven models based upon state-of-the-art machine learning techniques such as Naïve Bayes, Regression Tree, Classification Tree, C 4.5, Random Forest, Support Vector Machine, and CN2 learners were tested for predicting eight epi-macrobenthic species diversity metrics as a function of the class number. The Random Forest outperformed other models with a three-discretized Simpson index applied to epi-macrobenthic communities, explaining 69% (Classification Accuracy) of its variability by mean bathymetry, time range and skewness derived from the LiDAR waveform. Corroborating marine ecological theory, areas with low Simpson epi-macrobenthic diversity responded to low water depths, high skewness and time range, whereas higher Simpson diversity relied upon deeper bottoms (correlated with stronger hydrodynamics) and low skewness and time range. The degree of species heterogeneity was therefore positively linked with the degree of the structural complexity of the benthic cover. This work underpins that fully exploited bathymetric LiDAR (not only bathymetrically derived by-products), coupled with proficient machine learner, is able to rapidly predict habitat characteristics at a spatial resolution relevant to epi-macrobenthos diversity, ranging from clear to turbid waters. This method might serve both to nurture marine ecological theory and to manage areas with high species heterogeneity where navigation is hazardous and water clarity opaque to passive optical sensors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,175
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,049 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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