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Enregistrement W2068616327 · doi:10.1021/bi0480077

pH- and Metal Ion-Linked Stability of the Hemopexin−Heme Complex

2005· article· en· W2068616327 sur OpenAlexaff
Federico I. Rosell, Marcia R. Mauk, A. Grant Mauk

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHemopexinHemeChemistryMetalBiophysicsBiochemistryBiologyOrganic chemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thermal denaturation of the human hemopexin-heme complex was investigated under a variety of solution conditions to identify factors that influence heme release. The midpoint temperature for the transition between the folded and folded states, T(m), of the hemopexin-ferriheme complex exhibits a significant dependence on pH. When the pH is reduced from 7 to 5 (50 mM BisTris buffer and 50 mM NaCl), T(m) decreases by approximately 23 degrees C despite the relatively higher chloride concentration that tends to stabilize the protein. The thermal stability of the hemopexin-ferroheme complex was examined at pH 7.4 to yield a T(m) that is 3.2 degrees C lower than that of the hemopexin-ferriheme complex under identical conditions. The effect of transition metal ions, which hemopexin has recently been shown to bind [Mauk, M. R., Rosell, F. I., Lelj-Garolla, B., Moore, G. R., and Mauk, A. G. (2005) Biochemistry 44, XXXX-XXXX], was also considered. Cu(2+) and Zn(2+) had the greatest effect, reducing T(m) for the transition by 4.8 and 6.5 degrees C, respectively, relative to the value for the protein in the absence of metal ions [T(m) = 64.9 degrees C [10 mM sodium phosphate buffer (pH 7.4)]]. These metal ions also interfered significantly with the recovery of the native state from the unfolded protein when the protein on returning to 20 degrees C. The current results demonstrate how the conditions within the endosomes of hepatocytes (pH approximately 5.0, [Cl(-)] approximately 60 mM) and the potential presence of transition metal ions or heme iron reduction contribute to the membrane receptor-mediated process of heme release from hemopexin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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