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Enregistrement W2068959310 · doi:10.1371/journal.pone.0007109

Linking Chronic Infection and Autoimmune Diseases: Mycobacterium avium Subspecies paratuberculosis, SLC11A1 Polymorphisms and Type-1 Diabetes Mellitus

2009· article· en· W2068959310 sur OpenAlexaff
Daniela Paccagnini, Lee E. Sieswerda, Valentina Rosu, Speranza Masala, A. Pacifico, Maria Gazouli, John Ikonomopoulos, Niyaz Ahmed, Stefania Zanetti, Leonardo A. Sechi

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensThunder Bay Regional Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesUniversity of Hyderabad
Mots-clésMycobacterium avium subspecies paratuberculosisImmunologyType 1 diabetesParatuberculosisGenotypeBiologyMycobacteriumGeneticsDiabetes mellitusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The etiology of type 1 diabetes mellitus (T1DM) is still unknown; numerous studies are performed to unravel the environmental factors involved in triggering the disease. SLC11A1 is a membrane transporter that is expressed in late endosomes of antigen presenting cells involved in the immunopathogenic events leading to T1DM. Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) has been reported to be a possible trigger in the development of T1DM. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Fifty nine T1DM patients and 79 healthy controls were genotyped for 9 polymorphisms of SLC11A1 gene, and screened for the presence of MAP by PCR. Differences in genotype frequency were evaluated for both T1DM patients and controls. We found a polymorphism in the SLC11A1 gene (274C/T) associated to type 1 diabetic patients and not to controls. The presence of MAP DNA was also significantly associated with T1DM patients and not with controls. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: The 274C/T SCL11A1 polymorphism was found to be associated with T1DM as well as the presence of MAP DNA in blood. Since MAP persists within macrophages and it is also processed by dendritic cells, further studies are necessary to evaluate if mutant forms of SLC11A1 alter the processing or presentation of MAP antigens triggering thereby an autoimmune response in T1DM patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,678
Score d'incertitude au seuil0,710

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations107
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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