Genetic Variability of Canadian Populations of the Sapstain Fungus <i>Ophiostoma piceae</i>
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Genetic diversity was studied in seven Canadian populations of Ophiostoma piceae, the most prevalent sapstain fungus in Canadian softwoods. A total of 239 single-spore isolates were recovered following a systematic survey of sapstain fungi in logs and lumber at seven selected sawmills in six Canadian provinces (British Columbia, Alberta, Saskatchewan, Ontario, Québec, and New Brunswick). Sampling was carried out on five commercially important softwood species: balsam fir (Abies balsamea), white spruce (Picea glauca), black spruce (Picea mariana), jack pine (Pinus banksiana), and lodgepole pine (Pinus con-torta var. latifolia). The A and B mating types occurred at equal frequency (MAT A/ MAT B = 1.00:1.13) over all populations. Pseudo-allelic frequencies were estimated at each of 24 putative genetic loci by scoring for presence or absence of random amplified polymorphic DNA fragments generated by five primers. A total of 237 haplotypes were found among the 239 isolates, revealing a high level of genotypic diversity among isolates. Total gene diversity (H(T) = 0.414) was mostly attributable to diversity within populations (H(S) = 0.369). Thus, only 11.2% of the total variability was attributable to frequency differences among populations. An analysis of molecular variance revealed that most genetic variability occurred within subpopulations within mills (84.3%; P < 0.001), whereas low but statistically significant levels of genetic differentiation were also observed among subpopulations within populations (5.4%; P < 0.001) and among populations (10.3%; P < 0.001). Estimates of Nei' genetic distances were not correlated with geographic distances among sampling locations (r = -0.092; P = 0.310), although principal component analysis indicated that subpopulations located east of Saskatchewan were grouped on the same side of the second principal component axis. Overall, results suggest moderate genetic differentiation of O. piceae in Canada, which is consistent with the observation that sexual reproduction is frequently observed in this fungus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».