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Enregistrement W2069054825 · doi:10.1094/pdis-11-13-1121-pdn

First Report of Bloat Nematode (<i>Ditylenchus dipsaci</i>) Infecting Garlic in Ohio

2014· article· en· W2069054825 sur OpenAlexaboutno aff
Anna L. Testen, Ellie Walsh, Christopher G. P. Taylor, Sally A. Miller, Horacio D. Lopez‐Nicora

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBulbBiologyNematodeAllium sativumCropStyletHorticultureBotanyPEST analysisNematologyVeterinary medicineAgronomyAnatomyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bloat nematode, Ditylenchus dipsaci (Kühn) Filipjev (also known as stem and bulb nematode), is a key pest of garlic (Allium sativum) globally (1) as heavy infestations can lead to complete crop loss. Although not a major crop in Ohio, garlic is grown in diversified vegetable production systems. In July 2013, diseased garlic bulbs were received from a grower in Lorain County, OH, from a field with wide symptom distribution. Bulbs were discolored, exhibited splitting, and had basal plate damage including reduced roots. Nematodes were extracted for examination by placing bulb slices in water. Recovered nematodes had morphological characteristics of D. dipsaci, including a short stylet with prominent knobs, a distinct median esophageal bulb, a basal bulb slightly overlapping the intestine, a conical and pointed tail, and males with distinct bursa (1). To confirm the identity of the nematode, further morphological and molecular studies were performed. Nematode images were captured on a DM IRB inverted microscope (Leica Microsystems, Wetzlar, Germany) using a Retiga 2000 camera (Q Imaging, Surrey, Canada). Images were analyzed using Image J (NIH). For females (n = 16), means and ranges were: L = 1,080.1 (972.2 to 1,229.5) μm, a = 36.6 (33.5 to 41.9), b = 6.2 (5.3 to 6.8), c = 11.1 (9.1 to 12.8), and stylet 10.1 (8.9 to 11.2) μm. For males (n = 6), L = 1,589.2 (1,494 to 1,702.7) μm, a = 43.0 (40.7 to 46.0), b = 6.9 (6.4 to 7.3), c = 11.7 (9.2 to 13), with stylet 10.8 (10 to 12.2) μm and spicules 25.2 (23.8 to 26.8) μm. The measurements were highly similar to those of D. dipsaci (1). DNA was extracted from 50 to 100 nematodes using a PowerSoil DNA Isolation Kit (Mo-Bio Laboratories, Inc., Carlsbad, CA) as well as from individual females, and partial ITS sequences were amplified using primer set TW81/AB28 (3). The partial ITS sequences shared 99 to 100% sequence identity with GenBank accessions of D. dipsaci from garlic (DQ452956, JX123258). Expansion segments D2-D3 were sequenced following amplification of DNA from individual females using primer set D2A/D3B (4) and shared 99% sequence identity with D. dipsaci from garlic (FJ707362, JX123259). In this case, the grower noted bloat nematode symptoms following the introduction of new planting material into the field. Therefore, the availability of bloat nematode-free planting material or treated bulbs (2) is essential for preventing introduction of this pathogen. Once established, management options are limited as this nematode is difficult to eliminate. With this first report of D. dipsaci on garlic in Ohio, we have identified a new pest that can greatly reduce garlic yields in this state. References: (1) W. Nickle, ed. Ditylenchus. In: Manual of Agricultural Nematology, 1991. (2) P. Roberts et al. J. Nematol. 27:448, 1995. (3) S. Subbotin et al. Phytopathology 95:1308, 2005. (4) G. Tenente et al. Nematropica 34:1, 2004.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,175

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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