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Enregistrement W2069136535 · doi:10.1091/mbc.e14-10-1451

The Cdc15 and Imp2 SH3 domains cooperatively scaffold a network of proteins that redundantly ensure efficient cell division in fission yeast

2014· article· en· W2069136535 sur OpenAlexaff
Liping Ren, Alaina H. Willet, Rachel H. Roberts-Galbraith, Nathan A. McDonald, Anna Feoktistova, Jun‐Song Chen, Haiming Huang, Rodrigo X. Guillen, Charles Boone, Sachdev S. Sidhu, Janel R. Beckley, Kathleen L. Gould

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésCytokinesisBiologySchizosaccharomyces pombeCell biologySchizosaccharomycesSH3 domainCell Cycle ProteinCell divisionSeptinActin cytoskeletonCytoskeletonCellGeneticsSignal transductionCell cycleGeneSaccharomyces cerevisiaeProto-oncogene tyrosine-protein kinase Src

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schizosaccharomyces pombe cdc15 homology (PCH) family members participate in numerous biological processes, including cytokinesis, typically by bridging the plasma membrane via their F-BAR domains to the actin cytoskeleton. Two SH3 domain-containing PCH family members, Cdc15 and Imp2, play critical roles in S. pombe cytokinesis. Although both proteins localize to the contractile ring, with Cdc15 preceding Imp2, only cdc15 is an essential gene. Despite these distinct roles, the SH3 domains of Cdc15 and Imp2 cooperate in the essential process of recruiting other proteins to stabilize the contractile ring. To better understand the connectivity of this SH3 domain-based protein network at the CR and its function, we used a biochemical approach coupled to proteomics to identify additional proteins (Rgf3, Art1, Spa2, and Pos1) that are integrated into this network. Cell biological and genetic analyses of these SH3 partners implicate them in a range of activities that ensure the fidelity of cell division, including promoting cell wall metabolism and influencing cell morphogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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