MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2069262171 · doi:10.1111/j.1574-695x.2009.00634.x

Characterization of nontypeable<i>Haemophilus influenzae</i>collected from respiratory infections and invasive disease cases in Manitoba, Canada

2009· article· en· W2069262171 sur OpenAlexafffundabout
Michelle Shuel, Dennis K. S. Law, Stuart Skinner, John Wylie, James A. Karlowsky, Raymond S. W. Tsang

Notice bibliographique

RevueFEMS Immunology & Medical Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensShared HealthHealth Sciences CentreManitoba HealthUniversity of SaskatchewanPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesHealth CanadaImperial College LondonWellcome Trust
Mots-clésHaemophilus influenzaeBiologyMultilocus sequence typingSerotypeMicrobiologyAmp resistanceAmpicillinPasteurellaceaeRespiratory tract infectionsHaemophilusRespiratory tractRespiratory diseaseVirologyGenotypeRespiratory systemAntibioticsBacteriaGeneGeneticsMedicineInternal medicineLung

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

With the introduction of the Haemophilus influenzae serotype b (Hib) vaccine, invasive Hib disease has decreased substantially, but nontypeable H. influenzae (NT Hi) disease appears to be increasing. In order to understand the origin of NT Hi strains and their relationship with serotypeable strains, we analysed 125 NT Hi isolates collected from individual patients with either invasive disease (70 isolates) or respiratory tract infections (55 isolates). Serotype-specific and capsular transport genes were absent by PCR analysis, confirming their nonencapsulated status, which also suggested the NT Hi isolates were not encapsulated strains that shed their capsules. Multilocus sequence typing confirmed the NT Hi isolates did not have the same genetic background as serotypeable strains, including Hib. Despite the genetic heterogeneity found, two major genetic clusters were identified, both containing invasive and respiratory isolates. Fourteen invasive isolates and nine respiratory isolates produced beta-lactamase and were ampicillin resistant. More invasive (26.8%) than respiratory isolates (10.9%) showed decreased susceptibility towards ampicillin by a mechanism unrelated to beta-lactamase production. Besides a change in the capsule status of invasive Hi strains, the burden of invasive Hi disease, which used to be mainly a childhood disease, has now shifted to involve both adults and infants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,082

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEMS Immunology & Medical MicrobiologyMême sujetBacterial Infections and VaccinesTravaux en français237 207