Nuclear export competence of pre-40S subunits in fission yeast requires the ribosomal protein Rps2
Notice bibliographique
Résumé
Ribosome biogenesis is an evolutionarily conserved pathway that requires ribosomal and nonribosomal proteins. Here, we investigated the role of the ribosomal protein S2 (Rps2) in fission yeast ribosome synthesis. As for many budding yeast ribosomal proteins, Rps2 was essential for cell viability in fission yeast and the genetic depletion of Rps2 caused a complete inhibition of 40S ribosomal subunit production. The pattern of pre-rRNA processing upon depletion of Rps2 revealed a reduction of 27SA(2) pre-rRNAs and the concomitant production of 21S rRNA precursors, consistent with a role for Rps2 in efficient cleavage at site A(2) within the 32S pre-rRNA. Importantly, kinetics of pre-rRNA accumulation as determined by rRNA pulse-chases assays indicated that a small fraction of 35S precursors matured into 20S-containing particles, suggesting that most 40S precursors were rapidly degraded in the absence of Rps2. Analysis of steady-state RNA levels revealed that some pre-40S particles were produced in Rps2-depleted cells, but that these precursors were retained in the nucleolus. Our findings suggest a role for Rps2 in a mechanism that monitors pre-40S export competence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».