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Enregistrement W2069374155 · doi:10.1002/ajmg.a.36936

The <i>ACVRL1</i> c.314—35A&gt;G polymorphism is associated with organ vascular malformations in hereditary hemorrhagic telangiectasia patients with <i>ENG</i> mutations, but not in patients with <i>ACVRL1</i> mutations

2015· article· en· W2069374155 sur OpenAlexaff
Ludmila Pawlikowska, Jeffrey Nelson, Diana E. Guo, Charles E. McCulloch, Michael T. Lawton, William L. Young, Helen Kim, Marie E. Faughnan

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVascular Anomalies and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNIH Clinical CenterNational Institutes of HealthRare Diseases Clinical Research Network
Mots-clésACVRL1TelangiectasesTelangiectasiaMedicineGenotypePhenotypePolymorphism (computer science)EndoglinPathologyGeneGastroenterologyGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hereditary hemorrhagic telangiectasia (HHT) is characterized by vascular malformations (VMs) and caused by mutations in TGFβ/BMP9 pathway genes, most commonly ENG or ACVRL1. Patients with HHT have diverse manifestations related to skin and mucosal telangiectases and organ VMs, including arteriovenous malformations (AVM). The clinical heterogeneity of HHT suggests a role for genetic modifiers. We hypothesized that the ACVRL1 c.314-35A>G and ENG c.207G>A polymorphisms, previously associated with sporadic brain AVM, are associated with organ VM in HHT. We genotyped these variants in 716 patients with HHT and evaluated association of genotype with presence of any organ VM, and specifically with brain VM, liver VM and pulmonary AVM, by multivariate logistic regression analyses stratified by HHT mutation. Among all patients with HHT, neither polymorphism was significantly associated with presence of any organ VM; ACVRL1 c.314-35A>G showed a trend toward association with pulmonary AVM (OR = 1.48, P = 0.062). ACVRL1 c.314-35A>G was significantly associated with any VM among patients with HHT with ENG (OR = 2.66, P = 0.022), but not ACVRL1 (OR = 0.79, P = 0.52) mutations. ACVRL1 c.314-35A>G was also associated with pulmonary AVM and liver VM among ENG mutation heterozygotes. There were no significant associations between ENG c.207G>A and any VM phenotype. These results suggest that common polymorphisms in HHT genes other than the mutated gene modulate phenotype severity of HHT disease, specifically presence of organ VM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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