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Enregistrement W2069383309 · doi:10.1159/000049037

Affinity Binding of Glycosaminoglycans with β<sub>2</sub>-Microglobulin

2002· article· en· W2069383309 sur OpenAlexaff
Kenichi Ohashi, Robert Kisilevsky, Masaki Yanagishita

Notice bibliographique

Revue˜The œNephron journals/Nephron journals · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmyloidosis: Diagnosis, Treatment, Outcomes
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésGlycosaminoglycanChondroitin sulfateDissociation constantChemistryHeparan sulfateAffinity chromatographyMolecular biologyBeta-2 microglobulinPeptideBiochemistryInternal medicineBiologyReceptorMedicineEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A constant finding in beta (2)-microglobulin (beta 2m) amyloidosis is an increase in tissue heparan sulfate (HS) and chondroitin sulfate (CS) proteoglycans (PGs) at sites of amyloid deposits. However, the binding characteristics of PGs with beta 2m have not been elucidated yet. METHODS: Using affinity retardation chromatography, beta 2m- and glycosaminoglycan (GAG)-anchored columns, an affinity between beta 2m and GAGs was analyzed. Five peptides which spanned the entire beta 2m amino acid sequence were prepared, and an affinity between these peptides and heparin (HP) was examined. Furthermore, the specific binding of biotinylated beta 2m peptide for AA amyloid deposits via GAGs was examined on tissue sections. RESULTS: Using beta 2m-anchored column, HP showed the smallest dissociation constant (K(d)), i.e. the strongest affinity, among the GAGs examined. At 0.4 M NaCl, the K(d)s of beta 2m relative to BSA-anchored columns for HP, HS, CS-A, CS-B, and CS-C were 94, 620, 130, 660 and 190 microM, respectively. Using GAG-anchored columns, at 0.15 M NaCl, pH 7.4, beta 2m also showed an affinity for HP, with the K(d) relative to a reference column being 370 microM. Under the latter conditions, no beta 2m affinity for CSA was demonstrated. Among the five peptides, peptide-1, which is composed of residues 1-24, showed the highest affinity for HP, the K(d) being 190 microM. Peptides analogous to peptide-1, in which each basic amino acid was individually replaced by alanine, showed a remarkable decrease in affinity for HP. The specific binding of biotinylated beta 2m peptide for AA amyloid deposits via HS and CS was confirmed in situ by pretreatment with heparitinase and chondroitinase ABC. CONCLUSION: The present data indicate that HP/HS is effective in the binding of the beta 2m monomer, and the anatomic localization of beta 2m amyloid precursor protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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