Versican 3′‐untranslated region (3′‐UTR) functions as a ceRNA in inducing the development of hepatocellular carcinoma by regulating miRNA activity
Notice bibliographique
Résumé
This study was designed to explore the role of versican in the development of hepatocellular carcinoma (HCC). Ectopic expression of the versican 3′‐untranslated region (3′‐UTR) was studied as a competitive endogenous RNA for regulating miRNA functions. We used this approach to modulate the expression of versican and its related proteins in 3′‐UTR transgenic mice and in the liver cancer cell line HepG2, stably transfected with the 3′‐UTR or a control vector. We demonstrated that transgenic mice expressing the versican 3′‐UTR developed HCC and increased expression of versican isoforms V0 and V1. HepG2 cells transfected with versican 3′‐UTR displayed increased proliferation, survival, migration, invasion, colony formation, and enhanced endothelial cell growth, but decreased apoptosis. We found that versican 3′‐UTR could bind to miRNAs miR‐133a, miR‐199a*, miR‐144, and miR‐431 and also interacted with CD34 and fibronectin. As a consequence, expression of versican, CD34, and fibronectin was up‐regulated by ectopic transfection of the versican 3′‐UTR, which was confirmed in HepG2 cells and in transgenic mice as compared with wild‐type controls. Transfection with siRNAs targeting the versican 3′‐UTR abolished the effects of the 3′‐UTR. Taken together, these results demonstrate that versican V0 and V1 isoforms play important roles in HCC development and that versican mRNAs compete with endogenous RNAs in regulating miRNA functions.—Fang, L., Du, W. W., Yang, X., Chen, K., Ghanekar, A., Levy, G., Yang, W., Yee, A. J., Lu, W.‐Y., Xuan, J. W., Gao, Z., Xie, F., He, C., Deng, Z., Yang, B. B. Versican 3′‐untranslated region (3′‐UTR) functions as a ceRNA in inducing the development of hepatocellular carcinoma by regulating miRNA activity. FASEB J. 27, 907–919 (2013). www.fasebj.org
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».