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Enregistrement W2069515184 · doi:10.1016/j.myc.2014.12.002

Lectotypification, epitypification, and molecular phylogeny of the synnematous hyphomycete Pseudogliophragma indicum, the second genus in the Wiesneriomycetaceae

2015· article· en· W2069515184 sur OpenAlexaffabout
J. Pratibha, Hai D. T. Nguyen, Vadim A. Mel’nik, Darbhe J. Bhat, George P. White, Keith A. Seifert

Notice bibliographique

RevueMycoscience · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgharkar Research InstituteUniversity Grants Commission
Mots-clésBiologyHolotypeGenusSynonym (taxonomy)BotanyStipe (mycology)Phylogenetic treeMolecular phylogeneticsZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hyphomycete Pseudogliophragma indicum produces loosely constructed and often frayed synnemata, with a brown stipe and a divergent capitulum with monoblastic conidiogenous cells and deeply constricted phragmoconidia. Ramaraomyces corticola was described nine years after Ps. indicum with very similar micro-morphological characters. Both genera are monotypic. The holotype of Ps. indicum is depauperate. We re-collected Ps. indicum near the type locality. In this paper, we lectotypify the genus and species with the original illustration, and epitypify the species with a new specimen. An ex-epitype culture was derived from the epitype specimen and used to sequence regions of the nuclear RNA operon to determine the phylogenetic relationships of the species. The fungus belongs to the recently described family Wiesneriomycetaceae in the Tubeufiales, forming a sister group with the sporodochial, slimy spored genus Wiesneriomyces. We clarify the generic concept of Pseudogliophragma, propose Ramaraomyces as a synonym, and provide a new description and illustration. Wiesneriomyces laurinus is reported for the first time from Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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