A Simplified, Noninvasive Stool DNA Test for Colorectal Cancer Detection
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: As a noninvasive colorectal cancer (CRC) screening test, a multi-marker first generation stool DNA (sDNA V 1.0) test is superior to guaiac-based fecal occult blood tests. An improved sDNA assay (version 2), utilizing only two markers, hypermethylated vimentin gene (hV) and a two site DNA integrity assay (DY), demonstrated in a training set (phase 1a) an even higher sensitivity (88%) for CRC with a specificity of 82%. AIM: To validate in an independent set of patients (phase 1b) the sensitivity and specificity of sDNA version 2 for CRC. METHODS: Forty-two patients with CRC and 241 subjects with normal colonoscopy (NC) provided stool samples, to which they immediately added DNA stabilizing buffer, and mailed their specimen to the laboratory. DNA was purified using gel-based capture, and analyzed for hV and DY using methods identical to those previously published. RESULTS: Using the same cutpoints as the 1a training set (N = 162; 40 CRCs, 122 normals), hV demonstrated a higher and DY a slightly lower sensitivity, for a combined sensitivity of hV + DY of 86%. Optimal cutpoints based on the combined phase 1a + 1b dataset (N = 445; 82 CRCs, 363 normals) yielded a CRC sensitivity of 83%. The vast majority of cancers were detected regardless of tumor stage, tumor location, or patient age. Assay specificity in the phase 1b dataset for hV, DY, and hV + DY was 82%, 85%, and 73%, respectively, using the phase 1a cutpoints. Optimal cutpoints based on the combined phase 1a + 1b dataset yield a specificity of 82%. CONCLUSIONS: This study provides validation of a simplified, improved sDNA test that incorporates only two markers and that demonstrates high sensitivity (83%) and specificity (82%) for CRC. Test performance is highly reproducible in a large set of patients. The use of only two markers will make the test easier to perform, reduce the cost, and facilitate distribution to local laboratories.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle