Composite Survival Index to Compare Virulence Changes in Azole-Resistant Aspergillus fumigatus Clinical Isolates
Notice bibliographique
Résumé
Understanding resistance to antifungal agents in Aspergillus fumigatus is of increasing importance for the treatment of invasive infections in immunocompromised patients. Although a number of molecular resistance mechanisms are described in detail, the potential accompanying virulence changes and impact on clinical outcome have had little attention. We developed a new measure of survival, the composite survival index (CSI) to use as a measure of the virulence properties of A. fumigatus. Using a novel mathematical model we found a strong correlation between the in vitro growth characteristics and virulence in vivo expressed as CSI. Our model elucidates how three critical parameters (the lag phase (τ), decay constant (λ), and growth rate (ν)) interact with each other resulting in a CSI that correlated with virulence. Hence, strains with a long lag phase and high decay constant were less virulent in a murine model of invasive aspergillosis, whereas high virulence for isolates with a high CSI was associated in vitro with rapid growth and short lag phases. Resistant isolates with cyp51A mutations, which account for the majority of azole resistant aspergillosis cases, did not show a lower virulence compared to azole-susceptible isolates. In contrast, the CSI index revealed that a non-cyp51A-mediated resistance mechanism was associated with a dramatic decrease in CSI. Because of its predictive value, the mathematical model developed may serve to explore strain characteristics in vitro to predict virulence in vivo and significantly reduce the number of experimental animals required in such studies. The proposed measure of survival, the CSI can be used more in a general form in survival studies to explore optimal treatment options.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».