Canavan disease: Carrier‐frequency determination in the Ashkenazi Jewish population and development of a novel molecular diagnostic assay
Notice bibliographique
Résumé
Canavan disease (CD) is an autosomal recessive progressive neurodegenerative disorder prevalent in the Ashkenazi Jewish (AJ) population. The carrier rate for the most common mutations that cause CD in the AJ population is often quoted as 1:37-1:40. This is not supported by our finding of only two diagnosed cases of CD in the last 20 years in the Toronto AJ population of 160,000 and an estimated birth rate of 1,500-2,000 per year. Therefore, we embarked on a prevalence cross-sectional screening study to determine the carrier rate of CD in this population. In order to perform low-cost, high-throughput population testing for CD using molecular techniques, we first developed a novel molecular assay using multiplex fluorescent allele specific polymerase chain reaction (PCR) to test for the three most common mutations causing CD in the AJ population (A854C, C693A, C914A) and a neutral polymorphism at the site of the C693A mutation. During testing it was noted that individuals who were carriers of the A854C mutation also had a T polymorphism at the site of the C693A mutation (Y231X). We confirmed that in all A854C carriers the 854C mutation was in disequilibrium with the 693T polymorphism, indicating a founder chromosome for the A854C mutation in the AJ population. Twenty-five carriers were found from 1,423 samples yielding a carrier rate of 1:57, differing from the widely quoted frequency of 1:40 and supporting our observed frequency of disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».