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Enregistrement W2069757240 · doi:10.1371/journal.pone.0108790

The Prognostic Value of HPV Status and p16 Expression in Patients with Carcinoma of the Anal Canal

2014· article· en· W2069757240 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal and Anal Carcinomas
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Cancer Foundation
Mots-clésAnal canalOncologyValue (mathematics)Internal medicineMedicineAnal cancerExpression (computer science)CarcinomaCancer researchCancerStatisticsMathematicsRectumComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In anal cancer studies, the detection frequency of high-risk HPV (human papillomavirus) is variable, depending on the method used. There are limited data reporting results of different HPV detection techniques in the same clinical series, and very few correlating results with clinical outcome. OBJECTIVES: To evaluate tumor expression of p16/HPV16 using three different methods, and to determine their association with clinical outcome in patients with anal canal squamous cell carcinomas (SCC). DESIGN: This retrospective study included patients with anal canal SCC treated with definitive radiotherapy or chemoradiotherapy at a single institution between 1992 and 2005. Formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples from 53 of the 89 (60%) patient pre-treatment biopsies were adequate for tissue microarray construction. HPV status was determined using: p16 expression by conventional immunohistochemistry (IHC) and quantitative IHC (AQUA), HPV genotype analysis by chromogenic in situ hybridization (CISH) and HPV linear array sub-typing. Expression status was correlated with clinical outcome. RESULTS: 80% (28/35) of patient tumors had high p16 expression using conventional IHC. HPV16 CISH was positive in 81% (34/42) of tumors, and 78% (28/36) of tumors were HPV subtype 16. HPV16 CISH correlated with p16 evaluated by conventional IHC (correlation coefficient 0.46; p = 0.01) and by p16 AQUA score (correlation coefficient 0.49; p = 0.001). A subset of cases (15%) had very high p16 quantitative IHC scores (>244) and were associated with a higher incidence of local or distant recurrence (p = 0.04). CONCLUSIONS: The vast majority (80%) of anal canal SCC in our series were positive for HPV16/p16, regardless of the testing method used. The exploratory analysis of automated quantitative IHC scoring was the only technique to define a subset of patients with a worse prognosis by p16 expression status on univariate analysis. Further exploration of the molecular mechanisms of treatment resistance in association with very high p16 expression is warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,109

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle