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Enregistrement W2069789943 · doi:10.1007/s11427-011-4198-2

The structural biology of ryanodine receptors

2011· review· en· W2069789943 sur OpenAlexafffund
Lynn Kimlicka, Filip Van Petegem

Notice bibliographique

RevueScience China Life Sciences · 2011
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésRyanodine receptorEndoplasmic reticulumStructural biologyBiophysicsAllosteric regulationCytoplasmReceptorBiologyCalcium signalingIon channelCell biologyChemistryCrystallographyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ryanodine receptors are ion channels that allow for the release of Ca(2+) from the endoplasmic or sarcoplasmic reticulum. They are expressed in many different cell types but are best known for their predominance in skeletal and cardiac myocytes, where they are directly involved in excitation-contraction coupling. With molecular weights exceeding 2 MDa, Ryanodine Receptors are the largest ion channels known to date and present major challenges for structural biology. Since their discovery in the 1980s, significant progress has been made in understanding their behaviour through multiple structural methods. Cryo-electron microscopy reconstructions of intact channels depict a mushroom-shaped structure with a large cytoplasmic region that presents many binding sites for regulatory molecules. This region undergoes significant motions during opening and closing of the channel, demonstrating that the Ryanodine Receptor is a bona fide allosteric protein. High-resolution structures through X-ray crystallography and NMR currently cover ∼11% of the entire protein. The combination of high- and low-resolution methods allows us to build pseudo-atomic models. Here we present an overview of the electron microscopy, NMR, and crystallographic analyses of this membrane protein giant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,997
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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