The Dictyostelium class I myosin, MyoD, contains a novel light chain that lacks high-affinity calcium-binding sites
Notice bibliographique
Résumé
Dictyostelium discoideum MyoD, a long-tailed class I myosin, co-purified with two copies of a 16 kDa light chain. Sequence analysis of the MyoD light chain showed it to be a unique protein, termed MlcD, that shares 44% sequence identity with Dictyostelium calmodulin and 43% sequence identity with Acanthamoeba castellanii myosin IC light chain. MlcD comprises four EF-hands; however, EF-hands 2-4 contain mutations in key Ca2+-co-ordinating residues that would be predicted to impair Ca2+ binding. Electrospray ionization MS of MlcD in the presence of Ca2+ and La3+ showed the presence of one major and one minor metal-binding site. MlcD contains a single tryptophan residue (Trp39), the fluorescence intensity of which was quenched upon addition of Ca2+ or Mg2+, yielding apparent dissociation constants ( K'(d)) of 52 microM for Ca2+ and 450 microM for Mg2+. The low affinity of MlcD for Ca2+ indicates that it cannot function as a sensor of physiological Ca2+. Ca2+ did not affect the binding of MlcD to MyoD or to either of the two MyoD IQ (Ile-Gln) motifs. FLAG-MlcD expressed in Dictyostelium formed a complex with MyoD, but not with the two other long-tailed Dictyostelium myosin I isoenzymes, MyoB and MyoC. Through its specific association with the Ca2+-insensitive MlcD, MyoD may exhibit distinct regulatory properties that distinguish it from myosin I isoenzymes with calmodulin light chains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».