Genetic diversity at the UGT1 locus is amplified by a novel 3′ alternative splicing mechanism leading to nine additional UGT1A proteins that act as regulators of glucuronidation activity
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The gene UGT1 encodes phase II detoxification proteins involved in the elimination of small hydrophobic substances of both endogenous and exogenous origin. To date, nine functional UGT1A proteins are known to be produced from a single gene composed of alternative first exons shared with four common exons. Recently, a novel exon (referred to as exon 5b) was identified in the common shared region. RESULTS: We now reveal a novel alternative splicing mechanism and demonstrate that the exon 5a and the new exon 5b are alternatively spliced, generating several variant mRNAs and up to nine previously unknown variant UGT1A proteins, referred to as isoforms 2 or i2. Isoform-specific RT-PCR analyses reveal that the alternatively spliced mRNAs are widely distributed in human tissues. Immunoreactive proteins at the predicted molecular weight of approximately 45 kDa were confirmed in microsomes of human tissues using antibodies against UGT1A1 and anti-UGT1A7/8/9/10. Functional enzyme assays demonstrate that i2 proteins containing exon 5b are enzymatically inactive. On the other hand, co-expression experiments of i2 of UGT1A1, UGT1A7, UGT1A8 and UGT1A9 with their classical isoform 1 homologs results in a significant repression (15 to 79%) of UGT1A_i1-mediated drug metabolism. CONCLUSION: The UGT1A isoforms 2 act as negative modulators of their isoform 1 homologs in microsome preparations, revealing a new regulatory mechanism of the glucuronidation pathway. Findings further provide the first direct evidence of a novel alternative splicing mechanism at the 3' end of the UGT1 locus that further increases the number of proteins derived from this single gene.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle