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Enregistrement W2070086997 · doi:10.1186/1742-4690-9-s2-p186

Are the KIR3DS1homozygous and KIR3DL1*h/*y+HLA-B*57 genotypes associated protection from HIV by different routes of exposure?

2012· article· en· W2070086997 sur OpenAlexaff
Benjamin Tallon, Julie Bruneau, CM Tsoukas, Jean‐Pierre Routy, NF Bernard

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeHuman leukocyte antigenAntibodyImmunologyReceptorBiologyHuman immunodeficiency virus (HIV)MedicineGeneGeneticsAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously reported that HIV Exposed Seronegative (HESN) individuals have a higher frequency than HIV infected subjects of 2 genotypes: homozygosity for Killer Immunoglobulin-like Receptor (KIR) 3DS1 (KIR3DS1hmz) and homozygosity for high expression KIR3DL1 genotypes co-expressed with HLA-B*57 (*h/*y+B*57). KIR3DL1/S1 are Natural Killer (NK) cell receptors that influence NK functionality. Here, we assessed whether these genotypes were associated with protection by parenteral and mucosal routes of HIV exposure. 473 Caucasian individuals were typed for HLA, KIR3DL1/S1 generic genotypes and KIR3DL1 allotypes. Of 88 HESN, n=69 were injection drug users (IDU) and 19 were sexually exposed (sHESN). Of 385 HIV seropositive subjects n=108 were IDU and n=277 were infected through sexual exposure. The frequency of KIR3DS1hmz and *h/*y+B*57 carriers was compared in HESN versus HIV susceptible subjects exposed through parenteral versus mucosal routes. KIR3DS1hmz were more frequent among HESN than HIV positive IDU (10% versus 2.7%, respectively, p=0.05). This genotype was also more frequent among HESN than HIV infected individuals exposed sexually (25% versus 5.7%, respectively, p<0.01). The *h/*y+B*57 genotype was more frequent among HESN than HIV positive IDU (7.2 vs. 0%, respectively, p<0.01). This genotype was not observed among any sHESN and was detected in 1.8% of mucosally HIV infected individuals (p=not significant). The protective HESN KIR3DS1hmz genotype is associated with protection from HIV infection by both mucosal and parenteral routes. *h/*y+B*57 carriers are more frequent among IDU HESN than HIV susceptible subjects suggesting a protective effect via exposure by this route. Although there is no evidence that the *h/*y+B*57 genotype is protective at the level of sexual exposure the small number of sHESN precludes making firm conclusions on this point. Carriage of both these genotypes is linked to potency of NK cell function, which may influence early innate responses to HIV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,647
Score d'incertitude au seuil0,725

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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