Frequency of Chromosomally-Integrated Human Herpesvirus 6 in Children with Acute Lymphoblastic Leukemia
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Human herpesvirus 6 (HHV-6) is a ubiquitous pathogen infecting nearly 100% of the human population. Of these individuals, between 0.2% and 1% of them carry chromosomally-integrated HHV-6 (ciHHV-6). The biological consequences of chromosomal integration by HHV-6 remain unknown. OBJECTIVE: To determine and compare the frequency of ciHHV-6 in children with acute lymphoblastic leukemia to healthy blood donors. METHODOLOGY: A total of 293 DNA samples from children with pre-B (n=255), pre-pre-B (n=4), pre-T (n=26) and undetermined (n=8) leukemia were analyzed for ciHHV-6 by quantitative TaqMan PCR (QPCR) using HHV-6 specific primers and probe. As control, DNA samples from 288 healthy individuals were used. Primers and probe specific to the cellular GAPDH gene were used to estimate integrity and DNA content. RESULTS: Out of 293 DNA samples from the leukemic cohort, 287 contained amplifiable DNA. Of these, only 1 (0.35%) contained ciHHV-6. Variant typing indicates that the ci-HHV-6 corresponds to variant A. None of the 288 DNA samples from healthy individuals contained ciHHV-6. CONCLUSION: The frequency of ciHHV-6 in children with acute lymphoblastic leukemia is similar (p=0.5) to that of healthy individuals. These results suggest that acute lymphoblastic leukemia does not originate as a consequence to integration of HHV-6 within the chromosomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».