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Enregistrement W2070141684 · doi:10.1074/jbc.m307700200

Compartment-specific Protection of Iron-Sulfur Proteins by Superoxide Dismutase

2003· article· en· W2070141684 sur OpenAlexafffundabout
Fanis Missirlis, Jianguo Hu, Kim Kirby, Arthur J. Hilliker, Tracey A. Rouault, J. P. Phillips

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueMetalloenzymes and iron-sulfur proteins
Établissements canadiensYork UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEli Lilly and Company
Mots-clésAconitaseSOD2ParaquatSOD1Superoxide dismutaseCytosolMitochondrionSuperoxideBiochemistryFrataxinCell biologyChemistryReactive oxygen speciesBiologyOxidative stressEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iron and oxygen are essential but potentially toxic constituents of most organisms, and their transport is meticulously regulated both at the cellular and systemic levels. Compartmentalization may be a homeostatic mechanism for isolating these biological reactants in cells. To investigate this hypothesis, we have undertaken a genetic analysis of the interaction between iron and oxygen metabolism in Drosophila. We show that Drosophila iron regulatory protein-1 (IRP1) registers cytosolic iron and oxidative stress through its labile iron sulfur cluster by switching between cytosolic aconitase and RNA-binding functions. IRP1 is strongly activated by silencing and genetic mutation of the cytosolic superoxide dismutase (Sod1), but is unaffected by silencing of mitochondrial Sod2. Conversely, mitochondrial aconitase activity is relatively insensitive to loss of Sod1 function, but drops dramatically if Sod2 activity is impaired. This strongly suggests that the mitochondrial boundary limits the range of superoxide reactivity in vivo. We also find that exposure of adults to paraquat converts cytosolic aconitase to IRP1 but has no affect on mitochondrial aconitase, indicating that paraquat generates superoxide in the cytosol but not in mitochondria. Accordingly, we find that transgene-mediated overexpression of Sod2 neither enhances paraquat resistance in Sod1+ flies nor compensates for lack of SOD1 activity in Sod1-null mutants. We conclude that in vivo, superoxide is confined to the subcellular compartment in which it is formed, and that the mitochondrial and cytosolic SODs provide independent protection to compartment-specific protein iron-sulfur clusters against attack by superoxide generated under oxidative stress within those compartments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2003
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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