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Enregistrement W2070193172 · doi:10.1074/jbc.c800178200

Stromal Interaction Molecule (STIM) 1 and STIM2 Calcium Sensing Regions Exhibit Distinct Unfolding and Oligomerization Kinetics

2008· article· en· W2070193172 sur OpenAlexaff
Peter B. Stathopulos, Le Zheng, Mitsuhiko Ikura

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSTIM1Endoplasmic reticulumCell biologyCytoplasmBiophysicsGene isoformBiologyChemistryORAI1Biochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stromal interaction molecules (STIM) 1 and STIM2 are regulators of store-operated calcium (Ca(2+)) entry as well as basal cytoplasmic Ca(2+) levels in human cells. Despite a high sequence similarity (>65%) and analogous sequence-based domain architectures, STIM1 and STIM2 differentially influence these phenomena. Among all eukaryotes, the endoplasmic reticulum luminal portion of STIM proteins minimally encode EF-hand and sterile alpha-motif (SAM) domains (EF-SAM), which are responsible for sensing changes in Ca(2+) levels and initiating oligomerization. STIM oligomerization is a key induction step in the activation of Ca(2+)-permeable channels on the plasma membrane. Here, we show that the kinetic half-time of conversion from a monomeric to a steady oligomeric state is >70x shorter for STIM1 EF-SAM than STIM2 under similar conditions. Urea-induced rates of unfolding for STIM1 EF-SAM are >3x quicker when compared with STIM2, coherent with partial unfolding-coupled aggregation. Additionally, we demonstrate that the isoform-specific N-terminal residues beyond EF-SAM can influence the stability of this region. We postulate that distinct oligomerization dynamics of STIM isoforms have evolved to adapt to differential roles in Ca(2+) homeostasis and signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations177
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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